MASAMUNE-弐 ユーザーマニュアル
User manual(English)
計算材料学センター
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計算材料学センター
目次
Contents:
1. ログイン方法
1.1. 接続先ホスト名一覧
1.2. SSH公開鍵の登録
1.3. サーバへのログイン手順
1.4. SSHリレーサーバの操作方法
1.5. (参考)Tera TermでのSSHサーバへのログイン手順(Windows)
2. ストレージの構成と使用方法
3. ジョブの投入・管理
3.1. ジョブの投入コマンド(qsubコマンド)
3.2. 実行スクリプトの書式
3.3. インタラクティブモード
3.4. 共有キューへのジョブ投入方法
3.5. ジョブ管理コマンド
3.6. ノード時間消費と消費時間確認コマンド
3.7. MPIジョブの実行方法
3.8. キュー一覧
4. コンパイラ・ライブラリ使用方法
4.1. Intelコンパイラ
4.2. NVIDIA HPCコンパイラ
4.3. CUDA toolkit
4.4. ライブラリ使用方法
5. アプリケーション使用方法
5.1. アプリケーション一覧
5.2. Gaussian
5.3. GaussView 6
5.4. AVS/Express Developer
5.5. Materials Studio
5.6. CRYSTAL17
5.7. VASP 5
5.8. VASP 6
5.9. WIEN2k
5.10. ADF
5.11. ADF GUI
5.12. SIESTA
5.13. ABINIT
5.14. CPMD
5.15. QUANTUM ESPRESSO
5.16. LAMMPS
5.17. XCrySDen
5.18. Keras
5.19. TensorFlow
5.20. PyTorch
5.21. 日本語対応TeX
6. Python使用方法
6.1. Pythonの利用について
6.2. 前システムのpyenv環境の退避
6.3. pyenv環境の構築
6.4. 環境変数の設定
6.5. 動作確認
6.6. 基本的な使い方
6.7. 実行方法
7. CCMS JupyterLab
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LAMMPS
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アプリケーション使用方法
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XCrySDen
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XCrySDen
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注意
本コマンドは、X転送が前提となっています。
以下のコマンドを実行します。
$ xcrysden
以下の画面が起動します。
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