5.12. SIESTA

以下のバージョンが利用可能です。

バージョン	実行モジュールのパス	実行キュー
5.2.2	/work/app/SIESTA/siesta-5.2.2v3/_build-openmpi/Src/siesta	P_030 TP_002 MP_001 CP_001 DP_002 S_001 CS_001
5.4.1	/work/app/SIESTA/siesta-5.4.1/_build-openmpi/Src/siesta	P_030 TP_002 MP_001 CP_001 DP_002 S_001 CS_001

注意

実行時には以下を実行してください。

module load mkl-only/2025.0.1

module load openmpi/4.1.8_cpu

• ジョブ投入用スクリプト

#!/bin/sh
#PBS -l select=ノード数
#PBS -q キュー名
#PBS -N ジョブ名

module -s load mkl-only/2025.0.1
module -s load openmpi/4.1.8_cpu

cd ${PBS_O_WORKDIR}

mpirun [ -np 並列数 ][ -N ノードあたりの並列数 ] -hostfile $PBS_NODEFILE --oversubscribe /work/app/SIESTA/siesta-5.2.2v3/_build-openmpi/Src/siesta < 入力ファイル > 出力ファイル 2> エラー出力ファイル

• 使用例

#!/bin/sh
#PBS -l select=1
#PBS -q P_030
#PBS -N siesta

module -s load mkl-only/2025.0.1
module -s load openmpi/4.1.8_cpu

cd ${PBS_O_WORKDIR}

mpirun -np 112 -N 112 -hostfile $PBS_NODEFILE --oversubscribe /work/app/SIESTA/siesta-5.2.2v3/_build-openmpi/Src/siesta < input.fdf > siesta.out 2> siesta.er