5.13. ABINIT

以下のバージョンが利用可能です。

大規模並列計算サーバ

バージョン

実行モジュールのパス

実行キュー

10.2.7

/work/app/ABINIT/abinit-10.2.7_cpu/bin/abinit

P_030 TP_002 MP_001 CP_001 DP_002 S_001 CS_001

注意

実行時には以下を実行してください。

module load oneapi/2025.0.1

アクセラレータ搭載サーバ

バージョン

実行モジュールのパス

実行キュー

10.2.7

/work/app/ABINIT/abinit-10.2.7_gpu/bin/abinit

A_002 CA_001 DA_002

注意

実行時には以下を実行してください。

module load nvhpc/25.3

  • ジョブ投入用スクリプト

・大規模並列計算サーバ

#!/bin/sh
#PBS -l select=ノード数
#PBS -q キュー名
#PBS -N ジョブ名

module load oneapi/2025.0.1 2> /dev/null

cd ${PBS_O_WORKDIR}

export ABI_HOME=/work/app/ABINIT/abinit-10.2.7_cpu
export PATH=$ABI_HOME/bin:$PATH
export ABI_PSPDIR=$ABI_HOME/tests/Pspdir/

mpirun [ -np 並列数 ][ -ppn ノードあたりの並列数 ]  abinit 入力ファイル > 出力ファイル 2> エラー出力ファイル

・アクセラレータ搭載サーバ

#!/bin/sh
#PBS -l select=1[:ncpus=CPU数][:ngpus=GPU数]
#PBS -q CA_001
#PBS -N ジョブ名

module load nvhpc/25.3 2> /dev/null

cd ${PBS_O_WORKDIR}

export ABI_HOME=/work/app/ABINIT/abinit-10.2.7_gpu
export PATH=$ABI_HOME/bin:$PATH
export ABI_PSPDIR=$ABI_HOME/tests/Pspdir/

mpirun [ -np 並列数 ][ -N ノードあたりの並列数 ] -hostfile $PBS_NODEFILE -x LD_LIBRARY_PATH -x HCOLL_MAIN_IB=all abinit 入力ファイル > 出力ファイル 2> エラー出力ファイル
  • 使用例

・大規模並列計算サーバ


#!/bin/sh

#PBS -l select=1 #PBS -q P_030 #PBS -N abinit

module load oneapi/2025.0.1 2> /dev/null

cd ${PBS_O_WORKDIR}

export ABI_HOME=/work/app/ABINIT/abinit-10.2.7_cpu export PATH=$ABI_HOME/bin:$PATH export ABI_PSPDIR=$ABI_HOME/tests/Pspdir/

mpirun -np 112 -ppn 112 abinit input.abi > abinit.out 2> abinit.err

・アクセラレータ搭載サーバ

#!/bin/sh
#PBS -l select=1:ncpus=2:ngpus=2
#PBS -q CA_001
#PBS -N abinit

module load nvhpc/25.3 2> /dev/null

cd ${PBS_O_WORKDIR}

export ABI_HOME=/work/app/ABINIT/abinit-10.2.7_gpu
export PATH=$ABI_HOME/bin:$PATH
export ABI_PSPDIR=$ABI_HOME/tests/Pspdir/

mpirun -np 2 -N 2 -hostfile $PBS_NODEFILE -x LD_LIBRARY_PATH -x HCOLL_MAIN_IB=all abinit input.abi > abinit.out 2> abinit.err