5.17. CP2K¶
以下のバージョンが利用可能です。
バージョン |
実行モジュールのパス |
実行キュー |
|---|---|---|
2025.2 |
/work/app/CP2K/cp2k-2025.2_cpu/exe/Linux-intel-xd220v/cp2k.psmp |
P_030 TP_002 MP_001 CP_001 DP_002 S_001 CS_001 |
注意
実行時には以下を実行してください。
module load oneapi/2024.2.1
バージョン |
実行モジュールのパス |
実行キュー |
|---|---|---|
2025.2 |
/work/app/CP2K/cp2k-2025.2_gpu/exe/Linux-intel-xd670_cuda/cp2k.psmp |
A_002 CA_001 DA_002 |
注意
実行時には以下を実行してください。
module load oneapi/2024.2.1
module load cuda/12.8
ジョブ投入用スクリプト
・大規模並列計算サーバ
#!/bin/sh
#PBS -l select=ノード数
#PBS -q キュー名
#PBS -N ジョブ名
module load oneapi/2024.2.1 2> /dev/null
cd ${PBS_O_WORKDIR}
export CP2K_DATA_DIR=/work/app/CP2K/cp2k-2025.2_cpu/data
. /work/app/CP2K/cp2k-2025.2_cpu/tools/toolchain/install/setup
mpirun [ -np 並列数 ][ -ppn ノードあたりの並列数 ] -hostfile $PBS_NODEFILE /work/app/CP2K/cp2k-2025.2_cpu/exe/Linux-intel-xd220v/cp2k.psmp 入力ファイル > 出力ファイル 2> エラー出力ファイル
・アクセラレータ搭載サーバ
#!/bin/sh
#PBS -l select=1[:ncpus=CPU数][:ngpus=GPU数][:mem=メモリ容量]
#PBS -q CA_001
#PBS -N ジョブ名
module load oneapi/2024.2.1 2> /dev/null
module load cuda/12.8 2> /dev/null
cd ${PBS_O_WORKDIR}
export CP2K_DATA_DIR=/work/app/CP2K/cp2k-2025.2_gpu/data
. /work/app/CP2K/cp2k-2025.2_gpu/tools/toolchain/install/setup
mpirun [ -np 並列数 ][ -ppn ノードあたりの並列数 ] -hostfile $PBS_NODEFILE /work/app/CP2K/cp2k-2025.2_gpu/exe/Linux-intel-xd670_cuda/cp2k.psmp 入力ファイル > 出力ファイル 2> エラー出力ファイル
使用例
・大規模並列計算サーバ
#!/bin/sh
#PBS -l select=1
#PBS -q P_030
#PBS -N cp2k
module load oneapi/2024.2.1 2> /dev/null
cd ${PBS_O_WORKDIR}
export CP2K_DATA_DIR=/work/app/CP2K/cp2k-2025.2_cpu/data
. /work/app/CP2K/cp2k-2025.2_cpu/tools/toolchain/install/setup
mpirun -np 112 -ppn 112 -hostfile $PBS_NODEFILE /work/app/CP2K/cp2k-2025.2_cpu/exe/Linux-intel-xd220v/cp2k.psmp input.inp > cp2k.out 2> cp2k.err
・アクセラレータ搭載サーバ
#!/bin/sh
#PBS -l select=1:ncpus=16:ngpus=2:mem=160gb
#PBS -q CA_001
#PBS -N cp2k
module load oneapi/2024.2.1 2> /dev/null
module load cuda/12.8 2> /dev/null
cd ${PBS_O_WORKDIR}
export CP2K_DATA_DIR=/work/app/CP2K/cp2k-2025.2_gpu/data
. /work/app/CP2K/cp2k-2025.2_gpu/tools/toolchain/install/setup
mpirun -np 16 -ppn 16 -hostfile $PBS_NODEFILE /work/app/CP2K/cp2k-2025.2_gpu/exe/Linux-intel-xd670_cuda/cp2k.psmp input.inp > cp2k.out 2> cp2k.err