Wannier90
大規模並列計算サーバ
以下のバージョンが利用可能です。
バージョン | パス |
---|---|
1.2 | /work/app/Wannier90/wannier90-1.2 |
2.1.0 | /work/app/Wannier90/wannier90-2.1.0 |
3.1.0 | /work/app/Wannier90/current |
ジョブ投入用のスクリプトは以下の通りです。
#!/bin/sh #PBS -l select=ノード数 #PBS -q キュー名 #PBS -N ジョブ名 DIRNAME=`basename $PBS_O_WORKDIR` WORKDIR=/work/$USER/$PBS_JOBID mkdir -p $WORKDIR cp -raf $PBS_O_WORKDIR $WORKDIR cd $WORKDIR/$DIRNAME aprun [ -n 並列数 ][ -N ノードあたりの並列数 ] -j 1 /work/app/Wannier90/current/wannier90.x 入力ファイル > 出力ファイル 2> エラー出力ファイル cd; if cp -raf $WORKDIR/$DIRNAME $PBS_O_WORKDIR/.. ; then rm -rf $WORKDIR; fi
例)
#!/bin/sh #PBS -l select=1 #PBS -q P_016 #PBS -N wannier90 DIRNAME=`basename $PBS_O_WORKDIR` WORKDIR=/work/$USER/$PBS_JOBID mkdir -p $WORKDIR cp -raf $PBS_O_WORKDIR $WORKDIR cd $WORKDIR/$DIRNAME aprun -n 36 -N 36 -j 1 /work/app/Wannier90/current/wannier90.x wannier90 > wannier.out 2> wannier.err cd; if cp -raf $WORKDIR/$DIRNAME $PBS_O_WORKDIR/.. ; then rm -rf $WORKDIR; fi
実行モジュールの後に指定するのは、入力ファイルの拡張子の前の部分です。
アクセラレータサーバ
以下のバージョンが利用可能です。
バージョン | 実行モジュールのパス | 実行キュー |
---|---|---|
1.2 | /usr/local/app/Wannier90/wannier90-1.2 | A_004 |
2.1.0 | /usr/local/app/Wannier90/wannier90-2.1.0 | A_004 |
3.1.0 | /usr/local/app/Wannier90/current | A_004 |
ジョブ投入用のスクリプトは以下の通りです。
#!/bin/sh #PBS -l select=ノード数 #PBS -q キュー名 #PBS -N ジョブ名 module switch intel intel/19.1.0 DIRNAME=`basename $PBS_O_WORKDIR` WORKDIR=/work/$USER/$PBS_JOBID mkdir -p $WORKDIR cp -raf $PBS_O_WORKDIR $WORKDIR cd $WORKDIR/$DIRNAME mpirun [ -np 並列数 ][ -ppn ノードあたりの並列数 ] -hostfile $PBS_NODEFILE /usr/local/app/Wannier90/current/wannier90.x 入力ファイル > 出力ファイル 2> エラー出力ファイル cd; if cp -raf $WORKDIR/$DIRNAME $PBS_O_WORKDIR/.. ; then rm -rf $WORKDIR; fi
例)アクセラレータサーバへの投入
#!/bin/sh #PBS -l select=1 #PBS -q A_004 #PBS -N wannier90 module switch intel intel/19.1.0 DIRNAME=`basename $PBS_O_WORKDIR` WORKDIR=/work/$USER/$PBS_JOBID mkdir -p $WORKDIR cp -raf $PBS_O_WORKDIR $WORKDIR cd $WORKDIR/$DIRNAME mpirun -np 36 -ppn 36 -hostfile $PBS_NODEFILE /usr/local/app/Wannier90/current/wannier90.x wannier90 > wannier.out 2> wannier.err cd; if cp -raf $WORKDIR/$DIRNAME $PBS_O_WORKDIR/.. ; then rm -rf $WORKDIR; fi
実行モジュールの後に指定するのは、入力ファイルの拡張子の前の部分です。