====== WIEN2k ======
WIEN2kを使用可能な計算機サーバは以下の通りです。
  * [[application:wien2k#大規模並列計算サーバ|大規模並列計算サーバ]]
  * [[application:wien2k#並列計算・インフォマティクスサーバ|並列計算・インフォマティクスサーバ]]
  * [[application:wien2k#仮想サーバ|仮想サーバ]]
\\
<callout type="primary" title="重要" icon="true">
WIEN2kはライセンスをお持ちでない方は利用できません。利用希望者は[[https://www.sc.imr.tohoku.ac.jp/contact.html|こちら]]までその旨お問合せ下さい。\\
ライセンスを当センターにて確認させて頂いた後利用可能となります。\\
</callout>
\\
===== 大規模並列計算サーバ =====
以下のバージョンが利用可能です。
^バージョン  ^実行モジュールのパス  ^
|17.1  |/work/app/WIEN2k/current  |
|18.2  |/work/app/WIEN2k/WIEN2k_18.2  |
|19.1  |/work/app/WIEN2k/WIEN2k_19.1  |
|19.2  |/work/app/WIEN2k/WIEN2k_19.2  |
|21.1  |/work/app/WIEN2k/WIEN2k_21.1  |
|23.2  |/work/app/WIEN2k/WIEN2k_23.2  |
\\
ジョブ投入用のスクリプトは以下の通りです。
<code>
#!/bin/sh
#PBS -l select=ノード数
#PBS -q キュー名
#PBS -N ジョブ名

DIRNAME=`basename $PBS_O_WORKDIR`
WORKDIR=/work/$USER/$PBS_JOBID
mkdir -p $WORKDIR
cp -raf  $PBS_O_WORKDIR $WORKDIR
cd $WORKDIR/$DIRNAME

export SCRATCH=$WORKDIR/$DIRNAME
export TMPDIR=$WORKDIR/$DIRNAME
export WIENROOT=/work/app/WIEN2k/current
export PATH=$WIENROOT:$PATH
module load intel

aprun -b -d並列数 -j 1 --cc depth wien2k実行スクリプト オプションパラメータ > 出力ファイル 2> エラー出力ファイル

cd; if cp -raf $WORKDIR/$DIRNAME $PBS_O_WORKDIR/.. ; then rm -rf $WORKDIR; fi
</code>
\\
例）
<code>
#!/bin/sh
#PBS -l select=1
#PBS -q P_016
#PBS -N wien2k

DIRNAME=`basename $PBS_O_WORKDIR`
WORKDIR=/work/$USER/$PBS_JOBID
mkdir -p $WORKDIR
cp -raf  $PBS_O_WORKDIR $WORKDIR
cd $WORKDIR/$DIRNAME

export SCRATCH=$WORKDIR/$DIRNAME
export TMPDIR=$WORKDIR/$DIRNAME 
export WIENROOT=/work/app/WIEN2k/current
export PATH=$WIENROOT:$PATH
module load intel

aprun -b -d 36 -j 1 --cc depth run_lapw -p -cc 0.0001 -NI > wien2k.out 2> wien2k.err

cd; if cp -raf $WORKDIR/$DIRNAME $PBS_O_WORKDIR/.. ; then rm -rf $WORKDIR; fi
</code>
\\
並列実行させるには、実行スクリプトの中で-pオプションを指定し、.machinesファイルを実行ディレクトリに用意します。\\
\\
例）
<code>
$ cat .machines
1:localhost
1:localhost
1:localhost
1:localhost
1:localhost
1:localhost
1:localhost
1:localhost
1:localhost
1:localhost
1:localhost
1:localhost
1:localhost
1:localhost
1:localhost
granularity:1
extrafine:1
</code>
\\

===== 並列計算・インフォマティクスサーバ =====
以下のバージョンが利用可能です。
<callout title="重要" icon="true" type="primary">
バージョン19.2を使用する場合は、「intel 19.0.1」へ切り替えてください。
</callout>
\\
^バージョン  ^実行モジュールのパス  ^実行キュー  ^
|17.1  |/usr/local/app/WIEN2k/current  |C_002\\ C_004  |
|19.1  |/usr/local/app/WIEN2k/WIEN2k_19.1  |C_002\\ C_004  |
|19.2  |/usr/local/app/WIEN2k/WIEN2k_19.2\\ <color red>*「intel 19.0.1」へ切り替えてください</color>  |C_002\\ C_004  |

\\
ジョブ投入用のスクリプトは以下の通りです。
<code>
#!/bin/sh
#PBS -l select=ノード数
#PBS -q キュー名
#PBS -N ジョブ名

DIRNAME=`basename $PBS_O_WORKDIR`
WORKDIR=/work/$USER/$PBS_JOBID
mkdir -p $WORKDIR
cp -raf  $PBS_O_WORKDIR $WORKDIR
cd $WORKDIR/$DIRNAME
export SCRATCH=$WORKDIR/$DIRNAME 
export TMPDIR=$WORKDIR/$DIRNAME
export WIENROOT=/usr/local/app/WIEN2k/current
export PATH=$WIENROOT:$PATH

wien2k実行スクリプト オプションパラメータ > 出力ファイル 2> エラー出力ファイル

cd; if cp -raf $WORKDIR/$DIRNAME $PBS_O_WORKDIR/.. ; then rm -rf $WORKDIR; fi
</code>
\\
例）並列計算・インフォマティクスサーバへの投入
<code>
#!/bin/sh
#PBS -l select=1
#PBS -q C_002
#PBS -N wien2k

DIRNAME=`basename $PBS_O_WORKDIR`
WORKDIR=/work/$USER/$PBS_JOBID
mkdir -p $WORKDIR
cp -raf  $PBS_O_WORKDIR $WORKDIR
cd $WORKDIR/$DIRNAME
export SCRATCH=${PBS_O_WORKDIR}
export TMPDIR=$WORKDIR/$DIRNAME
export WIENROOT=/usr/local/app/WIEN2k/current
export PATH=$WIENROOT:$PATH

run_lapw -p -cc 0.0001 -NI > wien2k.out 2> wien2k.err

cd; if cp -raf $WORKDIR/$DIRNAME $PBS_O_WORKDIR/.. ; then rm -rf $WORKDIR; fi
</code>
\\
並列実行させるには、実行スクリプトの中で-pオプションを指定し、.machinesファイルを実行ディレクトリに用意します。\\
<code>
$ cat .machines
1:localhost
1:localhost
1:localhost
1:localhost
1:localhost
1:localhost
1:localhost
1:localhost
1:localhost
1:localhost
1:localhost
1:localhost
1:localhost
1:localhost
1:localhost
granularity:1
extrafine:1
</code>
\\
===== 仮想サーバ =====
以下のバージョンが利用可能です。
^バージョン  ^実行モジュールのパス  ^
|17.1  |/usr/local/app/WIEN2k/current  |
|19.1  |/usr/local/app/WIEN2k/WIEN2k_19.1  |

\\
以下のコマンドを実行します。
<code>
export SCRATCH=/work-nfs/$USER/scratch
export WIENROOT=/usr/local/app/WIEN2k/current
export PATH=$WIENROOT:$PATH

wien2k実行スクリプト オプションパラメータ
</code>
\\
例）
<code>
export SCRATCH=/work/$USER/scratch
export WIENROOT=/usr/local/app/WIEN2k/current
export PATH=$WIENROOT:$PATH

run_lapw -cc 0.0001 -NI
</code>