====== Wannier90 ======
Wannier90を使用可能な計算機サーバは以下の通りです。
* [[application:wannier90#大規模並列計算サーバ|大規模並列計算サーバ]]
* [[application:wannier90#アクセラレータサーバ|アクセラレータサーバ]]
\\
===== 大規模並列計算サーバ =====
以下のバージョンが利用可能です。
^バージョン ^パス ^
|1.2 |/work/app/Wannier90/wannier90-1.2 |
|2.1.0 |/work/app/Wannier90/wannier90-2.1.0 |
|3.1.0 |/work/app/Wannier90/current |
\\
ジョブ投入用のスクリプトは以下の通りです。
#!/bin/sh
#PBS -l select=ノード数
#PBS -q キュー名
#PBS -N ジョブ名
DIRNAME=`basename $PBS_O_WORKDIR`
WORKDIR=/work/$USER/$PBS_JOBID
mkdir -p $WORKDIR
cp -raf $PBS_O_WORKDIR $WORKDIR
cd $WORKDIR/$DIRNAME
aprun [ -n 並列数 ][ -N ノードあたりの並列数 ] -j 1 /work/app/Wannier90/current/wannier90.x 入力ファイル > 出力ファイル 2> エラー出力ファイル
cd; if cp -raf $WORKDIR/$DIRNAME $PBS_O_WORKDIR/.. ; then rm -rf $WORKDIR; fi
\\
例)
#!/bin/sh
#PBS -l select=1
#PBS -q P_016
#PBS -N wannier90
DIRNAME=`basename $PBS_O_WORKDIR`
WORKDIR=/work/$USER/$PBS_JOBID
mkdir -p $WORKDIR
cp -raf $PBS_O_WORKDIR $WORKDIR
cd $WORKDIR/$DIRNAME
aprun -n 36 -N 36 -j 1 /work/app/Wannier90/current/wannier90.x wannier90 > wannier.out 2> wannier.err
cd; if cp -raf $WORKDIR/$DIRNAME $PBS_O_WORKDIR/.. ; then rm -rf $WORKDIR; fi
実行モジュールの後に指定するのは、入力ファイルの拡張子の前の部分です。
\\
===== アクセラレータサーバ =====
以下のバージョンが利用可能です。
^バージョン ^実行モジュールのパス ^実行キュー ^
|1.2 |/usr/local/app/Wannier90/wannier90-1.2 |A_004 |
|2.1.0 |/usr/local/app/Wannier90/wannier90-2.1.0 |A_004 |
|3.1.0 |/usr/local/app/Wannier90/current |A_004 |
\\
ジョブ投入用のスクリプトは以下の通りです。
#!/bin/sh
#PBS -l select=ノード数
#PBS -q キュー名
#PBS -N ジョブ名
module switch intel intel/19.1.0
DIRNAME=`basename $PBS_O_WORKDIR`
WORKDIR=/work/$USER/$PBS_JOBID
mkdir -p $WORKDIR
cp -raf $PBS_O_WORKDIR $WORKDIR
cd $WORKDIR/$DIRNAME
mpirun [ -np 並列数 ][ -ppn ノードあたりの並列数 ] -hostfile $PBS_NODEFILE /usr/local/app/Wannier90/current/wannier90.x 入力ファイル > 出力ファイル 2> エラー出力ファイル
cd; if cp -raf $WORKDIR/$DIRNAME $PBS_O_WORKDIR/.. ; then rm -rf $WORKDIR; fi
\\
例)アクセラレータサーバへの投入
#!/bin/sh
#PBS -l select=1
#PBS -q A_004
#PBS -N wannier90
module switch intel intel/19.1.0
DIRNAME=`basename $PBS_O_WORKDIR`
WORKDIR=/work/$USER/$PBS_JOBID
mkdir -p $WORKDIR
cp -raf $PBS_O_WORKDIR $WORKDIR
cd $WORKDIR/$DIRNAME
mpirun -np 36 -ppn 36 -hostfile $PBS_NODEFILE /usr/local/app/Wannier90/current/wannier90.x wannier90 > wannier.out 2> wannier.err
cd; if cp -raf $WORKDIR/$DIRNAME $PBS_O_WORKDIR/.. ; then rm -rf $WORKDIR; fi
\\
実行モジュールの後に指定するのは、入力ファイルの拡張子の前の部分です。\\
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