====== Wannier90 ====== Wannier90を使用可能な計算機サーバは以下の通りです。 * [[application:wannier90#大規模並列計算サーバ|大規模並列計算サーバ]] * [[application:wannier90#アクセラレータサーバ|アクセラレータサーバ]] \\ ===== 大規模並列計算サーバ ===== 以下のバージョンが利用可能です。 ^バージョン ^パス ^ |1.2 |/work/app/Wannier90/wannier90-1.2 | |2.1.0 |/work/app/Wannier90/wannier90-2.1.0 | |3.1.0 |/work/app/Wannier90/current | \\ ジョブ投入用のスクリプトは以下の通りです。 #!/bin/sh #PBS -l select=ノード数 #PBS -q キュー名 #PBS -N ジョブ名 DIRNAME=`basename $PBS_O_WORKDIR` WORKDIR=/work/$USER/$PBS_JOBID mkdir -p $WORKDIR cp -raf $PBS_O_WORKDIR $WORKDIR cd $WORKDIR/$DIRNAME aprun [ -n 並列数 ][ -N ノードあたりの並列数 ] -j 1 /work/app/Wannier90/current/wannier90.x 入力ファイル > 出力ファイル 2> エラー出力ファイル cd; if cp -raf $WORKDIR/$DIRNAME $PBS_O_WORKDIR/.. ; then rm -rf $WORKDIR; fi \\ 例) #!/bin/sh #PBS -l select=1 #PBS -q P_016 #PBS -N wannier90 DIRNAME=`basename $PBS_O_WORKDIR` WORKDIR=/work/$USER/$PBS_JOBID mkdir -p $WORKDIR cp -raf $PBS_O_WORKDIR $WORKDIR cd $WORKDIR/$DIRNAME aprun -n 36 -N 36 -j 1 /work/app/Wannier90/current/wannier90.x wannier90 > wannier.out 2> wannier.err cd; if cp -raf $WORKDIR/$DIRNAME $PBS_O_WORKDIR/.. ; then rm -rf $WORKDIR; fi 実行モジュールの後に指定するのは、入力ファイルの拡張子の前の部分です。 \\ ===== アクセラレータサーバ ===== 以下のバージョンが利用可能です。 ^バージョン ^実行モジュールのパス ^実行キュー ^ |1.2 |/usr/local/app/Wannier90/wannier90-1.2 |A_004 | |2.1.0 |/usr/local/app/Wannier90/wannier90-2.1.0 |A_004 | |3.1.0 |/usr/local/app/Wannier90/current |A_004 | \\ ジョブ投入用のスクリプトは以下の通りです。 #!/bin/sh #PBS -l select=ノード数 #PBS -q キュー名 #PBS -N ジョブ名 module switch intel intel/19.1.0 DIRNAME=`basename $PBS_O_WORKDIR` WORKDIR=/work/$USER/$PBS_JOBID mkdir -p $WORKDIR cp -raf $PBS_O_WORKDIR $WORKDIR cd $WORKDIR/$DIRNAME mpirun [ -np 並列数 ][ -ppn ノードあたりの並列数 ] -hostfile $PBS_NODEFILE /usr/local/app/Wannier90/current/wannier90.x 入力ファイル > 出力ファイル 2> エラー出力ファイル cd; if cp -raf $WORKDIR/$DIRNAME $PBS_O_WORKDIR/.. ; then rm -rf $WORKDIR; fi \\ 例)アクセラレータサーバへの投入 #!/bin/sh #PBS -l select=1 #PBS -q A_004 #PBS -N wannier90 module switch intel intel/19.1.0 DIRNAME=`basename $PBS_O_WORKDIR` WORKDIR=/work/$USER/$PBS_JOBID mkdir -p $WORKDIR cp -raf $PBS_O_WORKDIR $WORKDIR cd $WORKDIR/$DIRNAME mpirun -np 36 -ppn 36 -hostfile $PBS_NODEFILE /usr/local/app/Wannier90/current/wannier90.x wannier90 > wannier.out 2> wannier.err cd; if cp -raf $WORKDIR/$DIRNAME $PBS_O_WORKDIR/.. ; then rm -rf $WORKDIR; fi \\ 実行モジュールの後に指定するのは、入力ファイルの拡張子の前の部分です。\\ \\