====== HPhi ====== HPhiを使用可能な計算機サーバは以下の通りです。 * [[application:hphi#大規模並列計算サーバ|大規模並列計算サーバ]] \\ ===== 大規模並列計算サーバ ===== ジョブ投入用のスクリプトは以下の通りです。 #!/bin/sh #PBS -l select=ノード数 #PBS -q キュー名 #PBS -N ジョブ名 DIRNAME=`basename $PBS_O_WORKDIR` WORKDIR=/work/$USER/$PBS_JOBID mkdir -p $WORKDIR cp -raf $PBS_O_WORKDIR $WORKDIR cd $WORKDIR/$DIRNAME export OMP_NUM_THREADS=ノードあたりの並列数 aprun [ -n ノード数 ][ -d ノードあたりの並列数 ] -j 1 --cc depth /work/app/HPhi/current/build/src/HPhi -s 入力ファイル > 出力ファイル 2> エラー出力ファイル cd; if cp -raf $WORKDIR/$DIRNAME $PBS_O_WORKDIR/.. ; then rm -rf $WORKDIR; fi \\ 例) #!/bin/sh #PBS -l select=1 #PBS -q P_016 #PBS -N hphi DIRNAME=`basename $PBS_O_WORKDIR` WORKDIR=/work/$USER/$PBS_JOBID mkdir -p $WORKDIR cp -raf $PBS_O_WORKDIR $WORKDIR cd $WORKDIR/$DIRNAME export OMP_NUM_THREADS=36 aprun -n 1 -d 36 -j 1 --cc depth /work/app/HPhi/current/build/src/HPhi -s stan.in > hphi.out 2> hphi.err cd; if cp -raf $WORKDIR/$DIRNAME $PBS_O_WORKDIR/.. ; then rm -rf $WORKDIR; fi