====== HPhi ======
HPhiを使用可能な計算機サーバは以下の通りです。
* [[application:hphi#大規模並列計算サーバ|大規模並列計算サーバ]]
\\
===== 大規模並列計算サーバ =====
ジョブ投入用のスクリプトは以下の通りです。
#!/bin/sh
#PBS -l select=ノード数
#PBS -q キュー名
#PBS -N ジョブ名
DIRNAME=`basename $PBS_O_WORKDIR`
WORKDIR=/work/$USER/$PBS_JOBID
mkdir -p $WORKDIR
cp -raf $PBS_O_WORKDIR $WORKDIR
cd $WORKDIR/$DIRNAME
export OMP_NUM_THREADS=ノードあたりの並列数
aprun [ -n ノード数 ][ -d ノードあたりの並列数 ] -j 1 --cc depth /work/app/HPhi/current/build/src/HPhi -s 入力ファイル > 出力ファイル 2> エラー出力ファイル
cd; if cp -raf $WORKDIR/$DIRNAME $PBS_O_WORKDIR/.. ; then rm -rf $WORKDIR; fi
\\
例)
#!/bin/sh
#PBS -l select=1
#PBS -q P_016
#PBS -N hphi
DIRNAME=`basename $PBS_O_WORKDIR`
WORKDIR=/work/$USER/$PBS_JOBID
mkdir -p $WORKDIR
cp -raf $PBS_O_WORKDIR $WORKDIR
cd $WORKDIR/$DIRNAME
export OMP_NUM_THREADS=36
aprun -n 1 -d 36 -j 1 --cc depth /work/app/HPhi/current/build/src/HPhi -s stan.in > hphi.out 2> hphi.err
cd; if cp -raf $WORKDIR/$DIRNAME $PBS_O_WORKDIR/.. ; then rm -rf $WORKDIR; fi